Rokiškio rajone telkšo 103 ežerai:
| Kodas | Ežero pavadinimas | Plotas, ha |
|---|---|---|
| Ablainas | 1,3 | |
| 12230754 | Akmenis | 0,95 |
| 42030002 | Alseta | 18,2 |
| 12230767 | Apeikiškio ežeras | 13,8 |
| 42030046 | Apvalasai | 43,9 |
| 42030042 | Armonių ežeras | 13,4 |
| 42030010 | Audrelis | 14,1 |
| 12230710 | Audrelis | |
| 12241612 | Aukštakalnių ežeras | 26,6 |
| 12231029 | Ažubalių ežeras | 6,6 |
| 12230812 | Baltelis | 3,9 |
| 12230810 | Baltys | 3,9 |
| 12230973 | Bedugnis | 0,78 |
| 12241617 | Bedugnys | 50,5 |
| 12230998 | Bedugnys | 6,9 |
| 12231025 | Bevardis | |
| 42030043 | Bevardis | |
| 12230976 | Bevardis | |
| 12231033 | Bevardis | |
| 12230756 | Budriškio ežeras | 1,2 |
| 42040045 | Čedasas | 42,4 |
| 12240876 | Degučių ežeras | 36 |
| 12230755 | Dėlinis | 2,2 |
| 12230766 | Dėlinis | 1,3 |
| 12230751 | Dirdų ežeras | 48,5 |
| 12230759 | Dručkų ežeras | 0,7 |
| 12230882 | Dubužis | 5,7 |
| 12230757 | Dumblinis | 8,8 |
| 42030031 | Dumblis (Baublių ežeras) | 30,6 |
| Duobžerys | 1,2 | |
| 12231511 | Dviragis | 317 |
| 12230823 | Eglinis | 5,5 |
| 42030047 | Eikiniškio ežeras | 19,3 |
| 12230718 | Ežeras | |
| 12230999 | Gačionių ežeras | 53,4 |
| 12231034 | Gipinėlis | 0,34 |
| 12231035 | Gipinys | 14,7 |
| 42030041 | Ignotiškio ežeras | 15,2 |
| 12230875 | Ilgelis | 11,1 |
| 12230821 | Ilgys | 26,8 |
| 42030044 | Ilgys (Garajis) | 89 |
| 12231028 | Juknas | 2,5 |
| 12230870 | Juodupis arba Juodasai | 1,3 |
| 12231000 | Jūžintas | 49 |
| 12230996 | Kaušelis | 2,1 |
| 12230874 | Keležeris | 34,2 |
| 12230712 | Kriaunelis | 31,7 |
| 12230764 | Kryžinis | 4,5 |
| 12230760 | Kubiliškio ežeras | 3,3 |
| 12230762 | Kukninis | 20,1 |
| 12230770 | Kuojinis | 6 |
| 42030030 | Kurkliečių ežeras | 15,9 |
| 12231024 | Lašų ežeras | 1,2 |
| 12230771 | Laumelis | 0,6 |
| 12230019 | Liminas | 14,8 |
| 12231619 | Liūnas | 2,2 |
| 12231611 | Luolelys | 1,3 |
| 12231610 | Luolys | 2,7 |
| 42030001 | Lūšna | 3,9 |
| 12230872 | Mėlyniokas | 3,7 |
| 12240873 | Mėlynis | 19,2 |
| 12230871 | Miškinis | 4,4 |
| 12230763 | Miškinis | 15,9 |
| 42030025 | Mitragalis | 2,5 |
| 12230714 | Našys | 91,1 |
| 12230713 | Obelių ežeras | 51,2 |
| 12231027 | Oklis | 2,8 |
| 12231026 | Okliukas | 0,15 |
| 12231030 | Ožiškis | 9,1 |
| 12230768 | Padvarinis | 1,7 |
| 12230717 | Paežerys | 1,2 |
| 12231032 | Pokenėlis | 0,75 |
| 12231031 | Pokenės ežeras | 10,2 |
| Panemunėlio ežeras | 4,5 | |
| 42030003 | Panemunio ežeras | 4,5 |
| 12241512 | Petrošiškio ežeras | 60 |
| 12231615 | Plynabalė | 4,7 |
| 12230018 | Rašai | 163,2 |
| 12230765 | Ratuokliškio ežeras | 1,9 |
| 12230711 | Rokiškėlių ežeras | 18,5 |
| 12230816 | Salinis | 40,8 |
| Samanėlis | 1,2 | |
| 12230017 | Sartai | 1332 |
| 12231510 | Sietuviškis | 15,8 |
| 42030032 | Skaistė | 58 |
| Skaistinės ežeras | 1,4 | |
| 12230822 | Skaistinės ežeras | 26,3 |
| 12230997 | Subatas | 30,7 |
| 12230761 | Sulpys | 16,3 |
| 12230750 | Šapelių ežeras | 17,2 |
| 12231613 | Šetekšnėlis | 1,4 |
| 12241614 | Šetekšnis | 21 |
| 12230769 | Trebūtinis | 15,3 |
| 12241618 | Uosintas | 30,6 |
| 12231001 | Vaginėlis | 1,3 |
| Varležeris | 0,93 | |
| Varlių ežeras | 1,1 | |
| 12231622 | Vazajėlis | 4,8 |
| 12231621 | Vazajis | 81 |
| 12230974 | Verležeris | 0,7 |
| Vertybiškio ežeras | 0,2 | |
| 42030040 | Vyžuona | 26,9 |
| 12230949 | Zalvė | 25,8 |
Akmenės rajonas | Alytaus miestas | Alytaus rajonas | Anykščių rajonas | Biržų rajonas | Druskininkų savivaldybė | Elektrėnų savivaldybė | Ignalinos rajonas | Jonavos rajonas | Joniškio rajonas | Jurbarko rajonas | Kaišiadorių rajonas | Kalvarijos savivaldybė | Kauno miestas | Kauno rajonas | Kėdainių rajonas | Kelmės rajonas | Klaipėdos rajonas | Kretingos rajonas | Kupiškio rajonas | Lazdijų rajonas | Marijampolės savivaldybė | Mažeikių rajonas | Molėtų rajonas | Pagėgių savivaldybė | Pakruojo rajonas | Palangos savivaldybė | Panevėžio rajonas | Pasvalio rajonas | Plungės rajonas | Prienų rajonas | Radviliškio rajonas | Raseinių rajonas | Rietavo savivaldybė | Rokiškio rajonas | Skuodo rajonas | Šakių rajonas | Šalčininkų rajonas | Šiaulių miestas | Šiaulių rajonas | Šilalės rajonas | Šilutės rajonas | Širvintų rajonas | Švenčionių rajonas | Tauragės rajonas | Telšių rajonas | Trakų rajonas | Ukmergės rajonas | Utenos rajonas | Varėnos rajonas | Vilkaviškio rajonas | Vilniaus miestas | Vilniaus rajonas | Visagino savivaldybė | Zarasų rajonas